取卵是在注射了人绒毛膜促性腺激素的35～36小时内进行。过早或过迟取卵都会影响卵的取出率和取出卵的质量。过早可能会使卵子未能完全成熟，有较多的未成熟卵，而过迟有可能使一些大卵泡排卵，因此取不到卵。


取卵术是在B超下引导经阴道穿刺的手术，然后在负压吸引下抽吸干净卵泡液，并敏捷移交给培育室于显微镜下查看、捡出卵子。

手术时刻大约5~15分钟。当然这不是绝对的，具体的时刻还是要视乎卵泡的多少和卵巢的方位而定。若大卵泡较少，则取卵时刻较短(2-5分钟左右)，随着大卵泡数目的增加，取卵时刻也会相应增加。一些特殊情况如卵巢方位不佳者也会导致取卵时刻的增加。少量取卵困难的朋友，取卵时刻会比较长，和卵泡数也会不成正比。